L’orgue de Grézels proviendrait de l’ancien petit séminaire de Montfaucon (Lot) fondé en 1835. On attribuerait sa construction à Georges Venner vers 1850. Il aurait ensuite été placé dans l’église de Grézels par Jean-Baptiste Stoltz vers 1895. L’achat et le transport de l’orgue ont couté 1 200 francs. L’instrument contenait à l’origine 5 jeux. C’est vraisemblablement à la fin du XIXe siècle que fut rajoutée une toute petite boîte expressive à l’arrière du buffet, contenant deux dessus de jeux d’anches.
En 1948, l’orgue fut réparé par un non professionnel, sans conséquence pour la partie instrumentale qui fut classé Monument Historique en 1982.
Et en 2002, c’est Patrice Bellet qui le restaure entièrement.